毛果芸香碱的副作用主要包括以下几个方面：

1. 可能会出现缩瞳的现象，导致眼压升高，出现青光眼的症状。
2. 可能会出现过敏反应，导致局部出现瘙痒、红肿的现象。
3. 可能会出现调节痉挛，导致视物模糊、视力下降等症状。
4. 有些患者使用后还可能会出现腹泻、发热、头痛、恶心等不适症状。

因此，在使用毛果芸香碱时，需要在医生的指导下进行使用，如果出现任何不适的症状，需要立即停药，并及时就医。