莫匹罗星软膏作为一种抗生素软膏，可能会产生一些副作用。最常见的是局部刺激反应，如发红、瘙痒、肿胀、灼热感或不适感。此外，它还可能与其他药物相互作用，导致某些副作用。因此，使用前务必咨询专业医生，遵循医生建议和注意事项。