过氧苯甲酰的副作用主要包括局部刺激、过敏反应和光敏反应。局部使用过氧苯甲酰后，可能会引起皮肤刺激、瘙痒、灼热感、发红和肿胀等刺激症状，严重程度和出现频率因人而异。过氧苯甲酰含有氧化剂，部分人可能会对其过敏，出现皮疹、瘙痒、皮肤糜烂等过敏症状，甚至可能出现呼吸急促、休克等。

请注意，如在使用过程中出现不适，请立即停止用药并寻求医疗建议。此外，过氧苯甲酰主要用作治疗痤疮的外用药物，涂抹时应保持皮肤清洁，避免进食刺激性食物，并遵医嘱。